D.U. Méthodes de gestion de bases de données en santé : programme

Le cours est structuré en modules, que nous conseillons d’effectuer dans l’ordre de leur numéro. Dans chacun d’eux, les parties théoriques sont illustrées d’exemples dans le domaine de la santé, et complétées d’exercices permettant d’assimiler le cours et de le mettre en application.

Module 1 : Analyse et conception d’une base de données

Ce module présente la méthodologie mise en œuvre lors des étapes de conception d’une base de données. Ceci comprend essentiellement deux grandes parties : les Formes Normales (jusqu’à la troisième Forme Normale) et le modèle Entité-Association.

Les Formes Normales fournissent des règles d’organisation des données, en vue d’éviter les anomalies graves de fonctionnement de la base qui pourraient se manifester lors de son utilisation future. Le modèle Entité-Association permet, face à une situation à informatiser, d’identifier clairement les groupes élémentaires de données en jeu ainsi que les liens entre ces éléments.

A l’issue de l’analyse "sur le papier" de la base de données, l’étudiant apprend tout d’abord à passer du modèle dit conceptuel au modèle physique de la base de données, c’est à dire à la dernière étape avant la création réelle de cette base de données sur ordinateur.

Module 2 : Interrogation d’une base de données

Ce module présente tout d’abord les principes de base de l’interrogation d’une base de données relationnelle, à travers le concept d’algèbre relationnelle.

La mise en pratique est ensuite abordée à travers SQL (Structured Query Language), langage qui fait référence dans le monde des bases de données relationnelles.

Les étudiants apprennent aussi la syntaxe des instructions SQL permettant de créer les tables, de déclarer les clés, et de mettre en place les contraintes d’intégrité et les mécanismes d’intégrité référentielle.

Module 3 : Recueil d’informations

Ce module vous propose une introduction aux bonnes règles de conception d’un recueil d’informations.

Ces recueils sont souvent à la source des données conservées dans les bases. Un recueil optimal de ces informations est une condition importante pour le stockage et l’exploitation future de ces données.

Module 4 : Gestion de données sous Système de gestion de bases de données relationnelles

La réalisation pratique de bases de données s’effectue avec un logiciel de gestion de base de données relationnelle. Il pourra s’agir :
 soit de Microsoft Access (version 2003 ou 2007),
 soit du module Base de la suite OpenOffice librement téléchargeable.

Que ce soit sous Access ou sous le module Base d’OpenOffice, les étudiants apprennent :
 à créer des tables de données, à préciser le schéma relationnel de la base et à mettre en place les contraintes d’intégrité,
 à interroger cette base sous la forme de requêtes (le parallèle avec les requêtes rédigées en SQL sera alors présenté),
 à réaliser des interfaces d’accès aux données (saisie, recherche, modification) grâce à la construction de formulaires dédiés (grilles de saisie permettant de préciser les zones d’affichage, d’utiliser des zones de listes, des cases à cocher, de déclencher des actions grâce à des boutons...).

Ce module aborde aussi l’exportation de données vers d’autres logiciels, ainsi que quelques exemples de récupération de données depuis des sources simples (fichiers Excel par exemple).

Module 5 : Gestion de données sous EpiInfo

Ce module traite de la gestion de données sous le logiciel EpiInfo (dans sa version sous Windows diffusée depuis l’année 2000). Les parties d’EpiInfo qui sont présentées concernent les aspects de manipulation des données : masque de saisie, correction de données, création de variables calculées, fusion, importation et exportation des données. Les fonctions d’analyse statistique qu’offre ce programme ne seront pas abordées (cette partie est présentée dans le DU Méthodes Statistiques en Santé).

Attention : ce logiciel n’est disponible que sur PC sous Windows, mais peut être utilisé sur d’autres systèmes grâce à un émulateur Windows (il vous incombera alors de tester par vous même de la compatibilité de l’émulateur avec ce logiciel).

Module 6 : Savoir-faire en bases de données

Ce module présente quelques solutions face à des questions couramment rencontrées dans le domaine des bases de données en santé :
 gestion de thesauri (valeurs de variables qualitatives),
 gestion d’identités multiples d’un même patient,
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